昌吉有國家級旅游風景區——高山湖泊天池、有始建于漢代的西域歷史名城北庭都護府遺址、有距今3000年歷史的呼圖壁康家石門子原始生殖崇拜巖畫、有恐龍化石發掘地、古森林化石群及鳴沙山、原始胡楊林等人文和自然奇觀。截至2013年,昌吉州建成國家A級景區26家,旅游星級賓館31家,星級農家樂126家,工業旅游示范點7家,旅游購物街5家。
北庭故城遺址
在吉木薩爾縣城北12公里處。千載春秋逝去,百遭戰火燼冷,北庭故城的雄風,在宏大的遺址上,仍然可以想見。
鐵瓦寺遺址
位于阜康市瑤池哈薩克族自治鄉境內,遺址位于天池西北岸700米處,是為紀念元代長春真人丘處機而建的道教寺院。現建筑全毀,建筑特征不詳。從殘存遺跡看,原規模長45米,寬45米面積2025米2。
博格達峰
博格達峰位于阜康市境內,與烏魯木齊直線距約60千米,西北與阜康市直線距約49千米,有柏油路面可通至天池,海拔5445米。峰區主要開展登山、科考、探險等活動,也有些游客喜歡穿越達坂,做翻越天山的考察活動。