牌坊上部樹立著高高的十字架，十字架下為一只銅雕鴿子，鴿子邊有太陽、月亮和星星;第4層中間的壁龕安置著耶穌銅像，兩邊分別刻有西方的百合花與東方的菊花圖案浮雕，這與同期曰本的裝飾圖案在內容與形式上相一致，從一個側面反映了日本文化在澳門的影響。

最為奇特的是牌坊的第3、4層左右兩邊都有中國傳統的獅子雕像，與中國廟宇山門前左右對稱放設的獅子形式頗為相似。在第3層正中是童貞圣母雕像，又有數位天使像和代表著中國的牡丹花和代表著曰本的菊花石刻圍繞其旁，形象地刻劃了包括日本在內的澳門教區的傳教范圍，這一層的左邊刻有"永恒之泉"字樣，一艘葡式帆船和一個面目掙獰的魔鬼形象，而右邊則刻著一棵生命之樹，邊上有圣母雙手合十站在一條尾巴很短的龍上，并有一行中文："圣母踏龍頭"。第2層壁龕設有4位耶穌會圣人雕像，并有3面門，正面大門上刻有"天主圣母"的拉丁文字樣，以下為堅實的花崗巖底座和原教堂的3扇進出大門,但現只剩下空蕩蕩的門框了。

大三巴牌坊于1991年進行過一次全面維修，現為澳門最著名的名勝古跡之凡來到澳門的游客，都要到這里參觀游覽。每逢周日和公眾假日，在牌坊前還有學校表演團體演出的中國傳統舞蹈節目供人觀賞。