保國寺始建于東漢。因位置在靈山山腰，故名靈山寺。 其背枕貿峰，左輔象鼻，右弼獅巖，寺幽而勢阻，地廊而形藏。唐會昌五年（845）滅佛，寺廢。廣明元年（880）重建，改名保國寺。宋治平二年（1065）起改名精進院，后又復稱保國寺。保國寺名聞遐邇，是以其精湛絕倫的建筑工藝而令人嘆為觀止。保國寺最初由山門、天王殿等建筑組成。現存大雄寶殿重建于北宋大中祥符六年（1013），是長江以南最古老、保存最完整的木結構佛教建筑，其結構獨特，氣勢恢宏。

清康熙二十三年（1684）加建重檐，成為歇山頂形成。千年大殿巍然如初，堪稱中國建筑文化奇葩，具有很高的歷史、藝術和科學價值。其主要特點是：平面布置進深（13.38米）大于面闊（11.83米），呈縱長方形；在前槽天花板上絕妙的安置了三個縷空藻井；復雜的斗拱結構；[四段合]作瓜棱柱，柱身有明顯的側腳；梁伏、闌額做成兩肩卷剎的月梁形式等。這些都接近或吻合于宋《營造法式》，承襲某些唐代建筑遺風，為研究宋代建筑提供了寶貴的實物例證。其他多為清代建筑。

一九八三年遷入明代廳堂三間，一九八四年遷入唐代經幢兩座，現在保國寺已成為一個擁有唐、宋、明、清、民國等各個時期的木構建筑群體。占地面積13000多平方米，建筑面積6000多平方米。中軸線上依次排列有山門、天王殿、大雄寶殿、觀音殿、藏經樓五幢建筑，東西軸線分別為鐘樓、鼓樓、客堂等附屬建設。一九六一年三月國務院把保國寺列為全國重點文物保護單位。保國寺內共有十七個展室，全天候對外開放。除了建筑本身，重要的文物展品有欽賜龍藏、佛像陳列、青銅禮器、磚雕石刻、中國的世界文化與自然遺產、千工床、萬工轎等。